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暫無(wú)內(nèi)容
1,杰毅本地化解決方案的包含了哪些內(nèi)容?
杰毅本地化解決方案包含微生物破壁儀、NGSmaster?自動(dòng)化建庫(kù)儀、儀器配套卡盒以及提取建庫(kù)試劑、病原微生物基因數(shù)據(jù)分析軟件及服務(wù)器,搭配 illumina 高通量測(cè)序儀為一整套病原微生物本地化解決方案,可以為醫(yī)療機(jī)構(gòu)快速實(shí)現(xiàn)本地化開(kāi)展病原微生物檢測(cè)。
2,杰毅本地化解決方案適配的測(cè)序平臺(tái)有哪些?
NGSmaster?自動(dòng)化建庫(kù)儀可搭配 illumina nextseq500/550、Miseq 等測(cè)序儀。
3,杰毅病原宏基因組本地化解決方案從樣本到報(bào)告需要多長(zhǎng)時(shí)間?
使用杰毅病原宏基因組本地化解決方案,從標(biāo)本到出具報(bào)告<13 小時(shí)。
4,NGSmaster?自動(dòng)化建庫(kù)儀的通量有多大?
NGSmaster?自動(dòng)化建庫(kù)儀標(biāo)準(zhǔn)是 4 個(gè)通道,一次可以做 1-4 個(gè)樣本。每個(gè)通道之間相互獨(dú)立,互不影響,可同時(shí)對(duì)不同類型的生物樣本進(jìn)行處理,也可以單個(gè)樣本即刻開(kāi)始提取建庫(kù),靈活方便,適用于臨床隨時(shí)來(lái)樣的檢測(cè)場(chǎng)景,也符合緊急情況下需要快速對(duì)單個(gè)或是少數(shù)樣本進(jìn)行建庫(kù)測(cè)序的需求。在臨床樣本量增加時(shí),也可以將多臺(tái)儀器進(jìn)行疊加使用,最多可以疊加 24 臺(tái)儀器(96 通道)。除了標(biāo)準(zhǔn)的 4 通道,還有單通道的儀器可選。
5,NGSmaster?自動(dòng)化建庫(kù)儀建庫(kù)可以構(gòu)建哪些文庫(kù),需要多長(zhǎng)時(shí)間?
使用 NGSmaster?自動(dòng)化建庫(kù)儀可以進(jìn)行 DNA 建庫(kù)和 RNA 建庫(kù)。生物樣本進(jìn),文庫(kù)出,提取建庫(kù)過(guò)程均儀器自動(dòng)完成,無(wú)需人工操作,DNA 文庫(kù) 2 小時(shí)完成,RNA 文庫(kù) 3.5 小時(shí)完成。
6,杰毅自動(dòng)建庫(kù)為什么只需要 2 個(gè)小時(shí)就能完成?
傳統(tǒng)的建庫(kù)為手工+PCR 建庫(kù)方式,至少需要 6-8 小時(shí)。杰毅的文庫(kù)構(gòu)建使用的是 PCR-free 的建庫(kù)技術(shù),建庫(kù)過(guò)程中不進(jìn)行 PCR 擴(kuò)增(5 步完成建庫(kù):核酸-片段化-補(bǔ)平加 A-連接-純化),從而節(jié)省了大量時(shí)間(PCR 方法建庫(kù)需要進(jìn)行多步純化和 PCR)。同時(shí)儀器自動(dòng)建庫(kù),也大大縮短了人為操作時(shí)間,實(shí)現(xiàn)了 2h 可以完成文庫(kù)的構(gòu)建。
7,為什么要使用 PCR-free 的建庫(kù)技術(shù),有什么優(yōu)勢(shì)?
(1)PCR-free 建庫(kù)技術(shù)無(wú) PCR 過(guò)程,避免了 PCR 氣溶膠污染的風(fēng)險(xiǎn)。
(2)PCR-free 建庫(kù)無(wú) PCR 產(chǎn)生的偏向性問(wèn)題,讓結(jié)果更真實(shí)。
(3)PCR-free 建庫(kù)技術(shù)步驟少,速度快,大大縮短了實(shí)驗(yàn)時(shí)間。
8,NGSmaster?自動(dòng)化提取建庫(kù)儀可以做的樣本類型有哪些?
NGSmaster?自動(dòng)化提取建庫(kù)儀適用的樣本類型非常全面,包括血漿、骨髓、肺泡灌洗液、腦脊液、胸腹水、膽汁、關(guān)節(jié)積液、尿液、膿腫抽液、房水、其它穿刺液、組織、痰液、鼻咽拭子保存液、傷口滲出液、肛周拭子等。
9,建庫(kù)完成后,樣本還需要進(jìn)行什么處理嗎,如何進(jìn)行質(zhì)控?
使用 NGSmaster?自動(dòng)化建庫(kù)儀,建庫(kù)程序完成之后,直接得到文庫(kù)樣本。只需要在測(cè)序前用熒光定量 PCR 儀進(jìn)行文庫(kù)定量質(zhì)控,質(zhì)控合格之后,完成 pooling 和 pooling 后質(zhì)檢,即可進(jìn)行上機(jī)測(cè)序。
10,NGSmaster?自動(dòng)化建庫(kù)儀占地大嗎,操作需要放在什么房間?
NGSmaster?自動(dòng)化提取建庫(kù)儀相比市面上常見(jiàn)的建庫(kù)設(shè)備,體積很?。?18mm*343mm*418mm),可以放置在生物安全柜內(nèi),并且由于建庫(kù)使用 PCR-free 建庫(kù)技術(shù),無(wú)氣溶膠污染,不需要放置在專門的 PCR 房間,一般放置在樣本制備間即可。
11,數(shù)據(jù)分析是如何進(jìn)行的和檢測(cè)報(bào)告是怎么出具的?
杰毅本地化解決方案中,數(shù)據(jù)分析使用杰毅專門的病原微生物基因數(shù)據(jù)分析軟件,該軟件搭載了物種信息系統(tǒng)、智能分析系統(tǒng)、深度解讀系統(tǒng)三大系統(tǒng),并留有 his 系統(tǒng)接口,可以進(jìn)行信息對(duì)接,可實(shí)現(xiàn)樣本查詢、管理等??梢暬膱?bào)告系統(tǒng),可為臨床一鍵式出具檢測(cè)報(bào)告,僅需 1 名臨床醫(yī)生對(duì)報(bào)告進(jìn)行審核即可。測(cè)序過(guò)程中邊測(cè)序邊分析,最快可實(shí)現(xiàn)下機(jī)后 10 分鐘出具報(bào)告。
數(shù)據(jù)分析可選云端數(shù)據(jù)解決方案和本地化數(shù)據(jù)方案,云端數(shù)據(jù)解決方案無(wú)需單獨(dú)配置服務(wù)器,數(shù)據(jù)全面更新快。本地化數(shù)據(jù)解決方案數(shù)據(jù)安全性高更高,適用于對(duì)數(shù)據(jù)安全要求較高的機(jī)構(gòu)。
12,檢測(cè)的內(nèi)容哪些內(nèi)容?
杰毅病原宏基因組檢測(cè)內(nèi)容含24419種病原微生物(細(xì)菌 11027 種,支原體 54 種,衣原體 12 種,立克次體 21 種,螺旋體 48 種,病毒 11704 種,真菌 1324 種,寄生蟲 229 種)和 2000 余種耐藥基因。
13,杰毅本地化解決方案有什么優(yōu)勢(shì)?
(1)配套的微生物破壁儀,通過(guò)三維高速震蕩破壁,可顯著提高真菌、分枝桿菌等難破壁微生物的檢出,避免漏檢;
(2)NGSmaster?一站式、自動(dòng)化建庫(kù)系統(tǒng)可快速、2h 無(wú)人值守,可自動(dòng)化完成樣本的核酸提取和文庫(kù)構(gòu)建,提升檢測(cè)時(shí)效性,降低污染風(fēng)險(xiǎn),保障了生物安全;
(3)配套的卡盒式試劑盒,實(shí)驗(yàn)前只需要將樣本和提取建庫(kù)反應(yīng)試劑都預(yù)先加入卡盒中,后續(xù)通過(guò)自動(dòng)化建庫(kù)儀自動(dòng)完成提取和文庫(kù)構(gòu)建,省時(shí)省力。
(4)采用了 PCR-free(免擴(kuò)增)建庫(kù)技術(shù),可顯著提升檢測(cè)時(shí)效性,規(guī)避 PCR 偏好性以及潛在的污染風(fēng)險(xiǎn),保證結(jié)果的真實(shí)性;
(5)本地化數(shù)據(jù)分析軟件集數(shù)據(jù)庫(kù)、自動(dòng)化分析軟件、智能化 AI 解讀于一體,無(wú)需生信分析人員,一鍵生成檢測(cè)報(bào)告,測(cè)序完成后最快可 10 分鐘出具報(bào)告。
杰毅生物技術(shù)在行業(yè)中的優(yōu)勢(shì)?
杰毅生物是專注于為臨床提供分子診斷服務(wù),秉承自主創(chuàng)新與追求卓越的理念,視自主研發(fā)的核心技術(shù)為生命,持續(xù)不斷地在臨床轉(zhuǎn)化領(lǐng)域進(jìn)行技術(shù)研發(fā)投入。自主研發(fā)了 Q-mNGS 定量技術(shù)、NGSmaster 自動(dòng)化檢測(cè)、PCR-free 建庫(kù)技術(shù)、微生物破壁儀、去人源技術(shù)等。
1) 從樣本到報(bào)告,全流程<13 小時(shí),業(yè)內(nèi)最快。
2) Q-mNGS 定量技術(shù)——可明確樣本中人源和病原體核酸含量,對(duì)真/假陰性結(jié)果進(jìn)行鑒別,可根據(jù)病原體含量的變化對(duì)抗感染療效進(jìn)行評(píng)估。
3) NGSmaster 病原宏基因組一體化建庫(kù)儀——全國(guó)唯一的全自動(dòng)一體化核酸提取建庫(kù)儀,每個(gè)樣本獨(dú)立空間內(nèi)完成核酸提取和文庫(kù)構(gòu)建,規(guī)避了實(shí)驗(yàn)員操作引入的背景菌以及樣本間的交叉污染,另外全流程僅需 2 小時(shí),提高了 mNGS 檢測(cè)是時(shí)效性。
4) PCR-free 技術(shù)——依托杰毅生物自主研發(fā)的建庫(kù)試劑,在文庫(kù)構(gòu)建環(huán)節(jié)去除了可能引起污染及結(jié)果偏差的多步純化步驟和 PCR 步驟,既提高了 mNGS 時(shí)效性,又規(guī)避了這些步驟可能導(dǎo)致的污染和結(jié)果偏差,使 mNGS 檢測(cè)結(jié)果更真實(shí)更準(zhǔn)確。
5) 微生物破壁儀——采用三維高速振動(dòng)的原理,配合不同粒徑的玻璃珠,可對(duì)分枝桿菌、真菌等厚壁微生物進(jìn)行高效破壁,提高其檢出率;另外相比超聲破碎儀可能導(dǎo)致核酸過(guò)片段化造成的部分病毒、細(xì)菌的漏檢,杰毅自研的微生物破壁儀不會(huì)影響易破壁微生物的檢出率。
6) 去人源技術(shù)——杰毅自研的去人源技術(shù)采用差異裂解法的原理,快速、高效的對(duì)樣本中人源細(xì)胞進(jìn)行去除,以提高微生物的檢出。根據(jù)與浙大一院的科研結(jié)果顯示,本方法可將微生物序列數(shù)占比平均提高 29.7 倍,且去人源全流程僅需 15 分鐘(其他類似方法需 2-4 小時(shí))。
7) 自建耐藥基因檢測(cè)數(shù)據(jù)庫(kù),從 2000 多種耐藥基因中挑選出 40 多個(gè)與表型耐藥強(qiáng)關(guān)聯(lián)的基因,在檢測(cè)病原物的同時(shí),提供耐藥信息,可以作為醫(yī)生臨床用藥的參考。
8) 自建病原數(shù)據(jù)庫(kù),補(bǔ)充真菌數(shù)據(jù)。
mNGS 檢測(cè)報(bào)告周期?
24 小時(shí)極致交付:實(shí)驗(yàn)室從標(biāo)本到報(bào)告<13 小時(shí)。
外周血、腦脊液、肺泡灌洗液等常見(jiàn)樣本類型的陽(yáng)性率?
外周血 50% 左右,腦脊液 40 - 50%,肺泡灌洗液 70 - 80%
耐藥基因臨床符合率?
據(jù)不完全統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)約 80%。
常見(jiàn)的 RNA 病毒有哪些?
樣本該如何選擇?
針對(duì)主要感染病灶在肺部的患者——送檢樣本:肺泡灌洗液> 痰液> 鼻咽拭子
針對(duì)除發(fā)熱外無(wú)其他感染部位的患者——送檢樣本:外周血> 骨髓
針對(duì)呼吸系統(tǒng)感染的兒童或不適宜取肺泡灌洗液的患者——送檢樣本:痰液> 鼻咽拭子
針對(duì)腸道感染的患者——送檢樣本:肛周拭子
針對(duì)中樞神經(jīng)系統(tǒng)感染的患者——送檢樣本:腦脊液> 外周血
不接受糞便樣本,但可以接收肛拭子
Q-mNGS?是什么?
Q-mNGS?全稱 Quality/Quantity mNGS(定量宏基因組檢測(cè)),實(shí)現(xiàn)了人源和病原體核酸的相對(duì)定量檢測(cè),可溯源樣本中病原及人源核酸的真實(shí)比例,實(shí)現(xiàn)真/假陰性的區(qū)分和治療效果的監(jiān)測(cè)。